匯算清繳多繳稅退回的流程主要為：1、在稅務部門申報和審核期間，如果發現納稅人多繳的稅款，可以申請稅務署準予先行退還；2、稅務部門審核通過后，將可以進行退還稅款；3、納稅人收到署退款通知后，應及時到財政部門報銷負擔稅款；4、財政部門收到稅款報銷申請后，檢查是否違反了稅收法規，如果是，則不予退還；5、如果符合稅收法規，則可以報送財政部機關進行審批并批準退款；6、財政部機關審批通過后，商業銀行將安排退款，納稅人可收到退款。 拓展知識：在稅務部門行政機關辦理匯算清繳手續時，管理者應盡快進行核查確認，以便將多繳稅款準確無誤地作為退款依據報送財政審批，如發現納稅人應繳稅款但未足額繳納的，應該及時補繳稅款，并給予行政處罰。