A公司根據《財務會計制度》的規定，對工程款的記賬處理應當以實際的付款情況為依據，具體處理方式如下： 首先，將所有實際付款劃歸為“付工程款”科目，并記入相應的付款屬性明細，如“工程款—材料專票38”“工程款—勞務專票40”“工程款—材料普票16”“工程款—工資”等。 其次，利用專票、普票和工資三類明細記賬，將A公司實際付款的財務明細記錄到各自的財務科目（如應交稅費科目），并進行財務分析處理，以明確稅務的申報情況。 此外，由于A公司**施工方，也應當根據**人之間的合同內容，對施工方**扣除的費用（如勞務費、材料費等費用）進行正確的計提處理。 總之，A公司記賬處理應當根據實際情況，合理設置相關財務科目，進行準確記賬，以免影響稅務申報和企業利潤的統計。 拓展知識：財務及會計科目的設置及記賬是企業會計的基礎工作，是企業會計的重要組成部分。正確的財務科目設置是企業會計報表的準確性和可靠性的保證，也是企業預算控制、成本控制、稅務申報等的重要依據。