小規模納稅人去年開出去的普票今年作廢，而去年開進來的成本票已經入賬，首先，應該根據有關法律法規，確定普票作廢時扣減稅款的方式，一般來說，扣減應納稅額時，可以采用有效發票扣減買方實際支付的銷售額，或者扣減銷售額后計算的應納稅額； 另外，對于未可抵扣的票據，也可以直接在銷項稅額減免表中申報； 此外，小規模納稅人可以根據《小規模納稅人銷項稅額減免暫行辦法》中的規定，扣減進項稅額。根據規定，小規模納稅人可以在申報應納稅額時，按照收付實際情況扣減正常交易發生的進項稅額，但應收付款和稅金不一致的，不得扣減； 最后，小規模納稅人也可以向稅務機關提出其它成本票據作廢，它可以申請納稅人抵扣，并在財務系統上進行書面核銷。 總之，小規模納稅人在處理作廢普票和成本票據時，需要根據有關法律法規，準確地確定扣減稅額的方式，并將其記錄在財務系統中，以確保納稅義務的正常履行。