處理專票上發票聯抵扣聯加蓋財務專用章的方法是： 首先，將專用章放置在財務專用章的位置，將抵扣聯或發票聯打印到規定的卡紙上，然后用財務專用章蓋在正確的位置上，最后將專用章印到適當的位置上。 拓展知識：財務專用章是企業財務對外簽署合同和開具發票的重要的法定憑證，是財務部門的必備印章，它具有法律效力，是企業的資產。因此，法律要求，專用章由財務部門或公司管理領導委托負責人保管使用。