在有關收入稅的規定中，合同中約定的增值稅征收稅率是準確可行的，無論當事人是否已經發出開票。所以，按照16%的增值稅征收稅率征收，與按照13%的增值稅征收稅率征收的區別是，差額3%的增值稅應該從發票中退還給當事人。所以，合同100萬元，應該退還100萬元乘以3%，即3000元作為增值稅退還給相關當事人。 拓展知識： 我國現行稅收制度中，在增值稅征收范圍內，當事人就其財產所發生的稅費及其他費用，由法律、行政法規等依據規定的情況，考慮其經濟利益和社會公共利益，應繳納或退還稅費及其他費用。