根據《合同法》規定，雙方約定的抵扣是可行的。甲乙雙方可以通過協商，約定乙方支付的租金可以抵銷乙方向甲方支付的裝修材料費用，雙方可以在合同中明確約定抵扣方式，乙方可以以租金的形式支付裝修材料費，雙方只有簽訂合同、明確合同條款，確認雙方所有權利義務的情況下，才能有效履行合同規定的雙方權利和義務。此外，雙方約定的抵扣也受到具體納稅實體的影響。若具體稅務實體是企業，則應遵循企業所得稅法律規定，如果被抵扣項目涉及到房地產銷售，需要繳納增值稅；若具體稅務實體是個人，則根據個人所得稅法的規定，可以減免相應的稅款。因此，在雙方抵扣問題上，仍需要根據不同的具體情況以及稅務實體的影響，綜合評估后再做出最終的決定。