國家對于機構所在地的稅款的申報要求，不能抵扣分包所預繳的稅款，而只能抵扣總包本單位預繳的稅款。這是因為分包和總包本質上是兩個不同的納稅主體，稅收征管的居民主體也是不同的，所以總包不能抵扣分包的稅款，這也是它們從而行政上分開管理的原因。 此外，總包和分包使用的各種財務規則也是不同的，比如分包把預繳稅款作為可抵稅收憑證，而總包則不可以，總包需要按時繳納稅款才能取得可抵稅收的憑證，否則將會影響總包的出口稅收結算，或是影響總包的納稅資質考核等等。所以，總包自己單位預繳的稅款是可以在機構所在地申報時進行扣除的，而分包預繳的稅款是不行的。