貸代承接的運輸業務的收費需要開具發票，并且根據國家的相關政策，在開具發票時需要按照不同的稅率計稅。根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》第四十二條規定：收費營業收入中收取的費用，如運輸費，按增值稅稅率計稅，一般是6%；但如果承運人提供的運輸服務涉及特定貨物，如貴金屬及其制品、具有明顯投資價值的化學制品及其制品、普通食品，則增值稅稅率計稅時，一般是9%。 貸代承接的運輸業務收費開具的發票的稅率，以上述規定都可以應用，由當事人協商確定。為了減輕稅收負擔，可以考慮對稅率及允許的減免稅政策做一定的研究，以便在最大程度上按照國家政策減免稅收負擔。此外，根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》第四十九條規定，貸代在收取運輸費時，須提供文件證明與當地稅務機關簽訂的增值稅稅收調整協議。