貨物單價和運費分別列明的話，在開票的時候只能將運費開到發票的稅額部分，不能把運費開到貨物單價里面，這樣開票會違反稅收管理規定，會影響企業的納稅資質，也會影響企業的征稅誠信水平，極可能引起稅務查處。稅收法律規定，公司發票要明確顯示質量、數量和單價，包括運費不能對貨物的單價進行填寫，只能作為本項目文庫的稅率條款，來作為發票稅率的依據，也可以將運費列在明細處。 需要強調的是，為了減少稅收管理糾紛，除了要遵守稅法規定，在開具發票時，企業還應引以為鑒，嚴格遵守發票管理規定，提高發票管理水平，按照規定正確填寫發票內容，避免違反稅收管理規定。 綜上所述，運費不能把運費開到貨物的單價里面，這樣開票會違規，企業應該按照規定正確填寫發票內容，特別是在開具發票時，必須根據開出發票的實際情況進行填寫，同時也要注意遵守稅收管理的規定。 此外，對于開票的有關知識，企業可以采取自主學習的方式，結合實際情況，及時補充、深入學習企業申報納稅細則相關知識，增加業務水平和技能水平，提高發票管理水平。