是的，建筑工程公司作為施工總承包方可以給甲方開材料發票。為了解決一些施工中使用材料對甲方的發票要求，我們可以在施工之后提供給甲方一份材料發票，其中需要詳細說明施工合同內所用材料的數量、規格、價格及甲方的支付事宜，同時，甲方應簽署“驗收施工材料”的文件，以證明收到材料發票的確認。此外，我們還應注意稅務稽查，對于現場施工材料的發票，一定要辦理稅務登記，妥善保存發票，確保不被封存。拓展知識：與材料發票相關的文件比較繁瑣，且要求極為苛刻，因此，在施工過程中，施工標段應積極管理好施工材料，以便在最后結算時提供有效的證明，避免出現質量或財務上的糾紛。