職工醫保扣費通常是通過社保費管理客戶端來完成的，一般社會保障局會提供一個客戶端給企業，企業可以在客戶端上添加職工信息，并記錄各項費用，比如醫療費用、住院費用、住房公積金等，企業可以在客戶端上記錄相關費用，從而方便社會保險中心的管理。拓展知識：此外，若企業集團有多個分支機構，企業集團可以使用集中式財務管理系統，實現對跨分支機構社會保險費用的集中管理，從而大大簡化企業的財務管理流程，加快企業的財務處理速度和效率。