電子普票作廢的話，一般需要經過正規的流程來處理。首先，應仔細核對電子普票是否完整無誤，以避免重復紅沖，確定電子普票存在瑕疵或作廢的情況，查驗原因；然后，進行紅沖操作，如涉及稅款扣收，需做好相關記錄；最后，如確有作廢的情況，辦結電子普票作廢登記及相關證明文件，并將原張電子普票和相關證明文件同時提交財政部門，財政部門確認后才算正式作廢。拓展知識：電子普票作廢，一般是因為發票號碼有誤，或者是發票內容有誤，又或者是訂單取消原因等原因才會進行作廢處理，作廢后應該把正確的發票更換出來，以免影響發票的真實性。