是的，如果個稅系統有兩個月沒有申報，就會罰款。根據最新公布的稅法規定，個稅按年度結算，申報期自次年1月1日至每年5月31日，今年全國到期申報日期5月31日，屬于違反稅法規定，應征收違反稅法規定罰款，根據《中華人民共和國稅收征收管理法》第六十六條第（一）款規定：“逾期未按時足額繳納或申報應納稅款的，處違約金，每逾期一日，按應納稅款金額的千分之一計收，最高不超過應納稅款金額的三倍”，罰款責任由個人負責，而非單位。拓展知識：自2018年起，個人所得稅簡化稅率由6檔變為3檔，法定起征點由2020年1月1日起調整至每月5000元。