公司在辦理留底退稅時，不會自動發注銷，而是由申報者自行報送需要發注銷的發票，如果發票申報完成后沒有發注銷，那么就會出現因超過退稅期限而無法退稅的情況。發注銷是指對指定發票的作廢，以此確保發票的完整性和真實性，在申報留底退稅的同時，也需要將相應的發票進行發注銷，否則會影響退稅進程。 拓展知識：發注銷的流程及作用： （1）發票發注銷的流程：填制發票發注銷申請表-->核對票據真實性信息-->辦理注銷-->重新開具發票； （2）發票發注銷的作用：1. 防止發票被偷竊或被冒用，防止票據被濫用；2.告知稅務機關發票已被注銷，防止發票重復申報；3.及時反映企業的經營狀況；4. 提高企業的票據的真實性，保證稅收的正確繳納；5. 防止發生不正當經營行為，合理對待稅收.