一般來說，農民工專戶代發的工資勞務公司做賬結轉成本時是按照含稅金額結轉。因為企業向農民工專戶代發的工資勞務費已經包含了社會保險費和個人所得稅，所以企業在結算成本時，需要把含稅金額結轉，以便能夠在財務賬目中體現出費用的真實成本。 在結算成本時，企業應注意因稅收補助或減免稅等影響，進行相應減免或補助處理，以便在結轉成本時保證準確的費用計算成本，保證財務收支的完整性。同時，企業還應注意做好對社會保險費和個人所得稅的繳納，以保證合規運營。 此外，企業在結算成本時，還需要注意針對農民工專戶代發的工資勞務費用，要按照業務程序，將工資勞務費用進行系統結算，以確保財務收支的完整性。