橫向科研項目經費到賬分錄，應以經費來源為依據，以貸方借方形式明示。如：科研經費收入、銀行存款等，收入應統一借計收入科目，貸計值收入成本科目；科研經費包括研發經費、費用等，均計借計支出科目，貸計預算科目。 至于到賬之后還要計提間接費用，分錄做法為：借計提間接費用科目，貸銀行存款科目、應付賬款科目、其他應收款科目等，即把申請到橫向科研項目經費以及其他間接費用收入增加到貸方科目中，同時表示公司從貸方來源獲得資金計提間接費用。 把橫向科研項目經費到賬，分錄以及計提間接費用，都受到了《最新會計準則》以及企業內部會計管理制度的約束，因此企業在制定本科目的會計政策時，需要根據實際情況綜合考慮，合理安排橫向科研項目經費的分錄及其相關的計提間接費用等事項。