這種情況下，甲乙兩個公司的做法是不合法的。根據中國稅務部門的規定，各種貿易往來必須開具稅務發票，用以證明出售的服務或產品的價格及稅收基數。因此，即使甲乙兩公司互相是客戶和供應商，他們也不能采取發票互抵的形式交易，以免違反稅務法規而被稅務機關罰款。 此外，發票是企業重要的財務憑證，反映了企業的交易信息和財務情況，也是企業社會信用的體現。正確使用發票有利于企業管理財務，發揮發票作為征稅憑證的功能，準確繳納稅款，確保企業繳納稅款的秩序，為企業發展營造良好的營商環境。因此，建議甲乙雙方正確使用發票，積極履行財稅義務，為企業發展促進稅收的正常征繳。