清包工項目稅率3%一般納稅人預繳稅款應該按照2%預繳增值稅。首先，可以從稅率來看，清包工項目納稅人一般可享受到3%的優惠稅率，但是針對預繳稅款，稅法規定按照普通稅率2%預繳增值稅，而不是清包工優惠的3%。其次，普通稅率的調整和變動比優惠稅率變動要小很多，更有利于稅收的及時性和準確性，也更便于納稅人計算和管理。此外，納稅人預繳稅款可以為當期銷售額做準備，減少階段稅收的壓力，并避免滯納罰款。總之，清包工項目稅率3%一般納稅人預繳稅款應按照2%預繳增值稅。 拓展知識：根據《中華人民共和國企業所得稅法》的規定，當納稅人的營業收入達到一定的標準時，可以申請一般納稅人身份，這時納稅人可以享受更多的減稅政策，比如清包工優惠稅率3%、研發費用加計扣除30%-50%。此外，一般納稅人還可享受善后返稅、科技型中小企業研發費用抵扣等優惠政策。