一般來說，在工程項目中分包下去的清包工的結算應該按照工程審計結論清算。這是因為工程審計結論總結了項目審計工作中收集到的所有有關項目經費，物資使用情況，項目完成狀態等信息，代表了項目的實際情況，是清包工結算審查的依據。按照審計結論清算，不僅能夠確保清包工收取到應得的結算款項，而且能夠減少支付資金的流失，提高項目財務支出的合規性。 此外，在實際操作中，分包下去的清包工結算還應結合項目合同和施工變更等情況進行，以保障工程項目的正常進行和合理完成，可以將清包工的結算審核環節納入項目的正常審批流程中，防止清包工的非法索賠，以維護項目的正常施工。