代發農民工工資時需要交稅，根據《中華人民共和國企業所得稅法》的規定，對雇主幫助農民工實現勞動報酬，且工資支付給國家認可的社會保險機構給予農民工所需支付的應納稅所得額，必須扣除應納稅所得額稅款。拓展知識：為了充分保護農民工權益，我國還出臺了《中華人民入共和國勞動合同法》，要求雇主應該與農民工形成雙方合意的勞動合同，明確雙方的權利義務，使得農民工獲得足夠的合法保護和公正的待遇。