專項附加扣除是指各項專項扣除，包括住房貸款利息、住房租金、子女教育、繼續教育、贍養老人、大病醫療等。根據《個人所得稅法》第12條規定，應納稅人為自己所得應納稅收入所提取專項附加扣除項目，應依法由增值稅銷項稅額扣除。 因此，一個人社保在一個單位交，工資在另一個公司交，那專項附加扣除應該是在增值稅所得稅的稅金計算中，由納稅人自行扣除，并將計算證明憑證提交給稅務機關。 拓展知識：專項附加扣除在進行報稅時，應由納稅人自行根據自己的實際情況選擇其中某一項或多項進行抵扣，只要符合規定的條件且具備相應的資料，可以享受多項專項扣除。納稅人應做好財務分類的準備，以正確識別自己的稅負，以期享受更多的專項抵扣降低稅收。