這種情況不違法吧？

可是在公司章程內第十四條：公司注冊資本已于公司注冊前繳足，這不是說明已經繳足一千萬了嗎？

那這就不符合規定了，已經交的那就是1000萬。

銀行轉賬的手續費，如沒有取得發票，可以做稅前扣除嗎？

是不能稅前扣除的，不能。