但是這樣怎么扣員工個稅，假如員工這個月不做了，下個月發工工資，再下個月才申報個稅，那這樣不是沒扣到個稅

你好，那你們算工資的時候提前把個稅算好。

發工資的時候就把他的個稅算好了，然后扣除了工資再發放給他。