我入賬金額和發票金額一樣，是什么原因有問題呢

這個是抵扣發票的核查，你看一下是不是有些異常發票不能抵扣。 【企業所得稅稅前扣除憑證（發票）風險提示反饋（“跟票管”）】—【反饋】進入反饋界面,列表按發票開具日期的時間順序展示異常發票（異常憑證和疑點發票）信息，優先顯示未反饋待辦任務

是不是只要顯示有風險提示的發票，我都需要做進項稅額轉出，同時已經記進費用的，所得稅調增呢？

你好，不是的呢。這個你要根據真實情況操作。該轉出就轉出，之前需要轉出的，是需要調增的呢