是在個稅APP上采集嗎？

可以的，可以在這里面采集的，有一個辦稅，上方有一個專項附加扣除。

對于沒有核對綜合所得稅種的個體戶，每月都沒有申報正常工資薪金，經營所得匯算能否填寫專項附加扣除？

采集的渠道除了個稅APP，還有其他的嗎？

自然人電子稅務局里面企業給你填寫。