我知道是可以選擇，如果我核算了A員工的獎金單獨核算可以少繳納個稅，但是后期員工匯算清繳的時候不是還需要補上嗎

匯算清繳的時候也是可以選擇不合并的，要不然這個就沒啥意義了。

那時候是員工自己選擇嗎

對到時候可以自己選擇的。

這樣啊，我以前一直沒搞懂，那員工可以兩種方法分別看看是否需要補稅？還是看不到結果直接提交

對，這個可以自己選擇，看哪種方式合適。

可以一部分獎金并入工資，一部分獎金單獨計稅嗎

可以呀，這個你企業自己安排金額就可以。