開票人換個名字，但是稅務局登記的會計是同一個人可以嗎？

這個倒是沒有問題，稅務可能也不會查的這么嚴。

還有就是這兩個公司報銷審批的領導都是一樣的，是不是也會有虛開發票的風險？雖然兩家法人不是同一個人。

報銷的話是沒啥問題的，主要是開票方面的問題。

如果兩個公司報銷單和附件上各個單位簽署的名字都是相同的人，然后兩家公司又有業務往來，開具專票。會不會容易判定關聯公司，虛開發票的風險。

對，這個肯定是會有風險的。