首先應該先確認零余額賬戶的性質，如果是企業自行設置的賬戶，只是當做零余額賬戶使用，則企業可以自行轉出對應的款項。如果是事業單位的財政付款的零余額賬戶，如果不小心匯入了款項，則需要向賬戶管理部門反應，是退回款項還是做其他的處理方式。