支付費用為四年總費用，應該每月分攤這些費用，他們那邊公司也將總費用發票開給我公司。應該掛哪個科目更合適？

即使對方將4年費用的發票全額開具給你們了，賬務處理依舊不變，剩余3年的還是掛賬預付賬款，分期攤銷。