根據《中華人民共和國稅收征收管理法》第三十條第三款的規定，稅務機關按照規定付給扣繳義務人代扣、代收手續費。你公司代扣、代收個人所得稅稅款，所以稅務機關按照《中華人民共和國稅收征收管理法》退還你公司代扣、代收手續費。 同時根據《中華人民共和國個人所得稅法》第十一條的規定對扣繳義務人按照所扣繳的稅款，付給百分之二的手續費。