實際運作中：1,保稅區以外的國內其他區域，稱為非保稅區；貨物實際是從國內出口到保稅區，報關單中的“運輸方式”填“非保稅區”。貨物運入保稅區，報關完畢后，海關不會立即簽發出口退稅聯，必須等該批貨物再實際報關離開我國國境后，憑原出口報關單和該批貨物離境的出境備案清單向該保稅區海關申請簽發出口退稅聯。2,如果從國內出口到保稅物流園區，可以馬上簽發退稅聯，不用等到貨物實際離境。即保稅區貨物出口與口岸同樣有法律效果。