一般納稅人快遞行業遇到總部開票金額大于公司開給總部發票金額時，處理方法如下： 核對內容：核對發票業務事項、金額計算是否準確。 確認原因：分析是業務量、費用分攤還是開票時間差異等原因導致。 賬務處理：按總部發票確認成本和應付賬款，按公司發票確認收入和應收賬款，根據差異情況后續調整。 溝通協調：財務與公司業務部門溝通，同時與總部相關部門聯系，核對數據協商解決方案。