農產品加計扣除1%的金額計算方法如下：
1. 首先需要確定農產品的銷售收入金額。
2. 然后將銷售收入金額乘以1%，得到加計扣除的金額。
3. 最后，將加計扣除的金額從銷售收入金額中減去，得到實際應納稅所得額。

例如，某農民銷售了10000元的農產品，那么加計扣除的金額為10000×1%=100元，實際應納稅所得額為10000-100=9900元。