民間非營利組織銀行手續費通常計入“管理費用”科目。這是因為銀行手續費是組織在日常經營活動中產生的，與生產經營無直接關系，屬于管理費用的范疇。在會計核算中，銀行手續費應當按照實際發生額計入管理費用科目，并在財務報表中進行披露。