在支付工資時，會計憑證中需要包含以下科目和金額：
1. 借記工資支出科目，金額為發放的工資總額。
2. 借記應交稅費科目，金額為應繳納的個人所得稅和社會保險費等稅費。
3. 貸記銀行存款科目，金額為發放的工資總額和應交稅費的總額之和。

例如，某公司在某月支付工資總額為10,000元，其中應繳納的個人所得稅和社會保險費等稅費總額為2,000元，那么會計憑證的分錄應為：

借：工資支出賬戶 10,000元
借：應交稅費賬戶 2,000元
貸：銀行存款賬戶 12,000元

需要注意的是，會計憑證的具體科目和金額應根據公司的具體情況而定，如公司有其他應付款項需要支付，還需在會計憑證中增加相應的科目和金額。