出售設備的凈收益應該計入“其他收益”科目。在會計準則中，其他收益是指與企業日常經營業務無直接關系的、非經常性的收益，包括非貨幣性資產的轉移、處置和報廢等。出售設備的凈收益屬于非經常性的收益，因此應該計入其他收益科目。