工程施工下設的二級科目可以根據具體情況而定，以下是一些常見的二級科目：
1. 施工成本類：人工費、材料費、機械使用費、施工保險費、施工安全費等。
2. 工程管理類：工程管理費、監理費、設計費、招標代理費、工程咨詢費等。
3. 費用支出類：水電費、通訊費、差旅費、招待費、辦公費等。
4. 稅費類：土地增值稅、城市維護建設稅、教育費附加、地方教育附加等。
5. 其他類：折舊費、維修費、租賃費、保險費、損失減少等。

需要注意的是，不同的工程項目可能會存在一些特殊的二級科目，需要根據具體情況進行設置。