【問】跨地區經營的總分支機構，總機構在深圳，有多家分支機構在外地，總機構與各分支機構的企業所得稅稅率都是不一樣，請問總機構在做年度企業所得稅申報時如何計算總機構應納稅額?

　　【答】根據《關于跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理若干問題的通知》（國稅函[2009]221號）的規定，預繳時，總機構和分支機構處于不同稅率地區的，先由總機構統一計算全部應納稅所得額，然后按照國稅發[2008]28號文件第十九條規定的比例和第二十三條規定的三因素及其權重，計算劃分不同稅率地區機構的應納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計算應納稅額后加總計算出企業的應納所得稅總額。再按照國稅發[2008]28號文件第十九條規定的比例和第二十三條規定的三因素及其權重，向總機構和分支機構分攤就地預繳的企業所得稅款。��

　　匯繳時，企業年度應納所得稅額應按上述方法并采用各分支機構匯算清繳所屬年度的三因素計算確定。��

　　除《國務院關于實施企業所得稅過渡優惠政策的通知》（國發[2007]39號）、《財政部 國家稅務總局關于企業所得稅若干優惠政策的通知》（財稅[2008]1號）和《財政部 國家稅務總局關于貫徹落實國務院關于實施企業所得稅過渡優惠政策有關問題的通知》（財稅[2008]21號）有關規定外，跨地區經營匯總納稅企業不得按照上述總分支機構處于不同稅率地區的計算方法計算并繳納企業所得稅，應按照企業適用統一的稅率計算并繳納企業所得稅。

　　所以，總分機構適用不同稅率時，請按文件規定執行。