一、初始計量會計與稅務處理差異
企業會計準則對長期股權投資的初始計量視取得投資方式有所區別，應當分別企業合并和非企業合并兩種情況確定。
�。ㄒ唬┓瞧髽I合并取得的長期股權投資
CAS 2規定，長期股權投資在取得時，應按初始投資成本入賬；《企業所得稅實施條例》（以下簡稱《條例》）規定，通過支付現金方式取得的投資資產，以購買價款為成本�？梢�，以支付現金方式取得的長期股權投資的計稅基礎與初始成本一致。長期股權投資初始計量方面的差異主要體現在：以非現金資產交換方式取得的長期股權投資成本的確定。
會計處理：《企業會計準則第7號——非貨幣性資產交換》（CAS 7）規定，以非現金資產交換方式取得的長期股權投資的成本，應區分公允價值計量和成本模式兩種情況確定。其中，在公允價值模式下，初始投資成本應以換出資產的公允價值為基礎確定；如果有確鑿證據表明換入資產的公允價值比換出資產的公允價值更加可靠。則以換人資產的公允價值為基礎確定。在成本模式下，初始投資成本應當以換出資產賬面價值為基礎確定換人資產成本。
稅務處理：《條例》規定，通過支付現金以外的方式取得的投資資產，以該資產的公允價值和支付的相關稅費為成本。理論上非現金資產交換是一種等價交換，公允價值不相等的通過補價解決，因此在公允價值模式下，長期股權投資的計稅基礎與初始成本一致：而在成本模式下，長期股權投資的計稅基礎是以換出資產的公允價值為基礎確定，其初始投資成本是以換出資產的賬面價值為基礎確定，因而其計稅基礎與初始投資成本不同，產生暫時性差異。
另外，財稅[2009]59號，企業股權收購、資產收購重組交易的稅務處理，應區分不同條件分別適用一般性和特殊性稅務處理規定：其一是特殊性稅務處理，如果企業重組同時符合特殊性重組規定的五個條件，企業取得的股權或資產的計稅基礎，可以選擇以被收購股權或被轉讓資產的原有計稅基礎確定，此時股權投資的計稅基礎與企業采用成本模式確定的投資成本一致。其二是適用一般性稅務處理，如果企業重組不能同時滿足特殊重組規定的條件，此時收購方確定的股權或資產的計稅基礎應以公允價值為基礎確定，投資的計稅基礎與企業采用公允價值模式計量確定的投資成本一致。特殊性重組條件：
�。�1）具有合理的商業目的，且不以減少、免除或者推遲繳納稅款為主要目的；
（2）被收購、合并或分立部分的資產或股權比例符合規定的比例；
（3）企業重組后的連續12個月內不改變重組資產原來的實質經營活動；
（4）重組交易對價中涉及股權支付金額符合本通知規定的比例；
�。�5）企業重組中取得股權支付的原主要股東，在重組后連續12個月內，不得轉讓所取得的股權。
其中，（2）和（4）所稱符合規定的比例是指：股權收購交易中，被收購股權比例不低于被收購全部股權的75％，且收購企業在該股權收購發生時的股權支付金額不低于其交易支付總額的85％；資產收購交易中，受讓企業收購的資產不低于轉讓企業全部資產的75％，且受讓企業在該資產收購發生時的股權支付金額不低于其交易支付總額的85％。可見，企業重組形成的長期股權投資，稅務處理中區分特殊性和一般性重組，會計處理中區分公允價值計量和成本模式。因此，在公允價值模式下，如果符合特殊性重組規定的條件，則長期股權投資的計稅基礎與初始成本不同，產生暫時性差異；年末匯算清繳時，對于會計處理中已確認的股權、資產轉讓所得和損失應進行納稅調整。在成本模式下，如果不符合特殊性重組規定的條件，則長期股權投資的計稅基礎與初始成本也不同，產生暫時性差異；年末匯算清繳時，對于會計處理中尚未確認的股權、資產轉讓所得和損失應進行納稅調整。
�。ǘ┢髽I合并形成的長期股權投資
企業合并應分別同一控制下控股合并與非同一控制下控股合并兩種情形，確定長期股權投資的初始投資成本。
�。�1）同一控制下控股合并取得的長期股權投資。會計處理：《企業會計準則第2號——長期股權投資》規定，同一控制下的企業合并，應當在合并日按照取得被合并方所有者權益賬面價值的份額作為長期股權投資投資成本，發生的直接相關稅費計入“管理費用”。若合并前被合并方與合并方采用的會計政策不同的，應當按照合并方的會計政策對被合并方資產、負債的賬面價值進行調整，在此基礎上確定長期股權投資的初始投資成本。稅務處理：《條例》規定，企業長期股權投資的計稅基礎，應當以為取得該項投資所付出的全部代價確定。企業實際發生的咨詢費、評估費等在發生的當期據實申報扣除。因此，同一控制下的企業合并的初始投資成本與計稅基礎的差異，主要體現在被合并方合并時所有者權益賬而價值的份額與實際付出代價之間的差異。
�。�2）非同一控制下的控股合并取得的長期股權投資。會汁處理：《企業會計準則第20號——企業合并》規定，非同一控制下的企業合并，購買方應當按照確定的企業合并成本作為長期股權投資的初始投資成本。其中，合并成本包括購買方為進行企業合并支付的現金或非現金資產、發行或承擔的債務、發行的權益性證券等在購買日的公允價值以及企業合并中發生的各項直接費用。稅務處理：所得稅的處理方法不區分同一控制下與非同一控制下取得的長期股權投資。企業合并中實際發生的各項直接相關費用，會計處理中計入投資成本，而稅法規定在發生的當期據實申報扣除。因此長期股權投資的計稅基礎與初始投資成本之間的差異，主要是企業合并時發生的各項直接相關費用。當然，如果企業合并滿足特殊性重組條件，則還包括企業合并成本與合并時原持有的股權的計稅基礎之間的差異。
二、后續計量會計與稅務處理差異
長期股權投資在持有期間，根據投資企業對被投資單位的影響程度以及是否存在活躍市場、公允價值能否可靠取得等進行劃分，應當分別采用成本法或權益法進行核算。但不論企業采用哪種方法核算，都不會改變所得稅的處理方法。
�。ㄒ唬╅L期股權投資采用成本法核算
成本法適用范圍：企業持有的能夠對被投資單位實施控制的長期股權投資以及投資企業對被投資單位不具有共同控制或重大影響，且在活躍市場中沒有報價、公允價值不能可靠計量的長期股權投資。
�。�1）被投資單位宣告分派現金股利或利潤。會計處理：《企業會計準則解釋第3號》（財會[2009]8號，以下簡稱“解釋3號”）。采用成本法核算的長期股權投資，投資企業取得被投資單位宣告發放的現金股利或利潤，除取得投資時實際支付的價款或對價中包含的已宣告但尚未發放的現金股利或利潤外，投資企業應當按照享有被投資單位宣告發放的現金股利或利潤確認投資收益，不再劃分是否屬于投資前和投資后被投資單位實現的凈利潤。而是一律計入當期“投資收益”科目，這與稅法確認收入的時間一致。稅務處理：《條例》規定，股息、紅利等權益性投資收益，除國務院財政、稅務主管部門另有規定外，按照被投資方作出利潤分配決定的日期確認收入的實現。居民企業直接投資于其他居民企業取得的投資收益，為免稅收入，但不包括連續持有居民企業公開發行并上市流通的股票不足12個月取得的投資收益。為此，居民企業之間的直接投資取得的投資收益，屬于免稅收入，因此年末匯算清繳時需作納稅調減處理。
（2）被投資單位宣告派發股票股利。會計處理：對于股票股利，不管企業采用成本法核算還是權益法核算，投資企業均不做賬務處理，只需在除權日備查登記增加的股數，以反映股數的變化。稅務處理：《條例》第十三條規定，企業以非貨幣形式取得的收入，應當依照公允價值確定收入額，其中，公允價值是指按照市場價格確定的價值。如果不屬于免稅收入，則年末匯算清繳時需作納稅調增處理。
�。�3）期末長期股權投資發生減值。會計處理：企業應當在會計期末判斷資產是否存在減值跡象，如果發生減值損失，不論企業采用成本法核算還是權益法核算，均應計提減值準備并計入當期損益。長期股權投資減值準備一經計提不得轉回，處置該投資時，相應結轉減值準備。稅務處理：《條例》規定，未經核定的各項資產減值準備、風險準備等準備金支出不得稅前扣除。但國稅發[2009]57號涉及了股權投資持有期間發生的靜態損失的處理。規定企業的股權投資符合下列條件之一的，減除可收回金額后確認的無法收回的股權投資，可以作為股權投資損失在計算應納稅所得額時扣除：被投資方依法宣告破產、關閉、解散、被撤銷，或者被依法注銷、吊銷營業執照的；被投資方財務狀況嚴重惡化，累計發生巨額虧損，已連續停止經營3年以上，且無重新恢復經營改組計劃的；對被投資方不具有控制權，投資期限屆滿或者投資期限已超過10年，且被投資單位因連續3年經營虧損導致資不抵債的；被投資方財務狀況嚴重惡化，累計發生巨額虧損，已完成清算或清算期超過3年以上的；國務院財政、稅務主管部門規定的其他條件。這樣，企業由于以上原因發生的減值，經稅務機關審批后，可以稅前扣除，從而減少了會計與稅務處理的差異。
（4）處置長期股權投資。會計處理：處置長期股權投資時，應結轉與所售股權相對應的長期股權投資的賬面價值，出售所得價款與處置長期股權投資賬面價值之間的差額，不論收益或損失，均應確認為處置損益。稅務處理：轉讓或者處置投資資產所得價款與投資資產的計稅基礎之間的差額，為股權轉讓所得（或損失）。由于會計上的賬面價值與計稅基礎可能不一致，導致長期股權投資處置損益與股權轉讓所得（或損失）金額相應存在差異，產生暫時性差異的一次性轉回，因此年末匯算清繳時需認真分析。對于企業實際發生的股權轉讓損失，國稅發[2009]88號文件規定，經稅務機關批準，可以在當年一次申報扣除。即企業發生的股權轉讓損失的會計處理與稅法規定一致。
（二）長期股權投資采用權益法核算
適用范圍：投資企業對被投資單位具有共同控制或重大影響的長期股權投資，即對合營企業及聯營企業的投資，應當采用權益法核算。
�。�1）初始投資成本調整。會計處理：CAS 2規定，長期股權投資的初始投資成本大于投資時應享有被投資單位可辨認凈資產公允價值的份額，兩者之間的差額不要求對長期股權投資的成本進行調整；初始投資成本小于取得投資時應享有被投資單位可辨認凈資產公允價值份額的，兩者之間的差額計入當期營業外敢人，同時調整增加長期股權投資的賬面價值。稅務處理：企業為取得該項投資實際發生的代價為該投資的計稅基礎。初始投資成本小于取得投資時應享有被投資單位可辨認凈資產公允價值份額的產生的營業外收入，不征收企業所得稅，年末匯算清繳時應作納稅調減處理。
�。�2）確認投資收益。會計處理：投資企業取得長期股權投資后，應當按照應享有或應分擔的被投資單位實現凈損益的份額，調整長期股權投資的賬面價值，并確認為當期投資損益。被投資方宣告分配現金股利或利潤時，相應的沖減投資成本，不確認投資收益。投資單位確認被投資單位的凈虧損，應當以長期股權投資的賬面價值以及其他實質上構成對被投資單位凈投資的長期權益減記至零為限，投資企業負有承擔額外損失義務的除外。稅務處理：《條例》規定，被投資方實現的利潤由被投資方繳納企業所得稅，其稅后利潤投資方不確認所得；被投資方發生的會計虧損，應由被投資方用以后年度的留存收益彌補，被投資方發生的稅務虧損，應由被投資方用以后年度實現的應納稅所得額彌補，彌補期不得超過5年。被投資方宣告分配股利或利潤時，投資方按照應享有的份額確認股息所得。這樣，在會計處理上，期末被投資單位實現凈損益時確認投資收益；而在稅務處理上，則只有當被投資方宣告分配時，投資方才確認股息所得。因此，年末匯算清繳時，一方而應將會計上確認的投資收益進行納稅調減；另一方面要區分股息所得是否屬于免稅收入，屬于應稅收入的部分應作納稅調增。
（3）投資企業對于被投資單位除凈損益以外所有者權益的其他變動。會計處理：投資企業對于被投資單位除凈損益以外所有者權益的其他變動，在持股比例不變的情況下，按照持股比例計算應享有或承擔的部分，調整長期股權投資的賬面價值，同時增加或減少資本公積（其他資本公積）。稅務處理：被投資企業其他權益變動不確認損失或所得，只有在處置時，才確認損失或所得。由于其他權益變動直接計入所有者權益，不影響會計利潤，因此不需作納稅調整。
長期股權投資發生減值以及轉讓或處置，其會計與稅務處理可參見成本法核算，長期股權投資處置時，會計上還應結轉原計入資本公積中的相關金額，確認為當期損益。