在商譽會計理論問題中，討論最為激烈持續時間最為長久的是商譽確認的問題。由于確認是計量、記錄、告的前提與基礎，有關商譽會計處理的很多問題是由確認問題引起的。因此，商譽的確認是極其重要的。

　　首先是自創商譽的確認。在自創商譽的確認問題上，目前會計實務界還沒有應用，就是理論界也很少有支持者。雖然大多數人承認自創商譽的存在，但各國會計準則都沒有明確的規定。國際會計準則委員會所發布的IAS22和我國的《具體會計準則》，均明確規定只有出現合并商譽時才作為一項資產入賬，這就限定了商譽確認的時間只能是在一個企業購買或合并另一企業時。英國的標準會計慣例公告《商譽會計》指出：合并商譽與自創商譽的特性沒有差別，然而由于特定時間上發生的市場交易這個事實，盡管對企業的計價是主觀的，合并商譽的價值可以被確定，而自創商譽是不可能的。這不僅反映了英國會計界對商譽的看法，而且也反映了會計界對商譽會計處理的一般態度：對合并商譽進行確認和計量；而自創商譽由于各種原因，不進行確認和計量。

　　其次是合并商譽的確認。合并商譽產生于企業合并，國外一些成功的企業合并表明，合并商譽占收購價格比重越來越大，因此應正確地確認合并商譽，否則將有悖于被并購方會計信息的真實性、完整性。

　　合并商譽的確認，依據不同的合并方式將產生不同的確認問題。一方面是同一控制下的企業合并中商譽的確認問題。同一控制下的企業合并，是指在一方或多方控制的情況下，一個企業獲得另一個或多個企業的股權或凈資產的行為。其主要特征是參與合并的各方，在合并前后均受同一方或相同的多方控制，并且不是暫時性的。對于這種情況我國新會計準則規定：合并方在企業合并中取得的資產和負債，應當按照合并日被合并方的賬面價值計量；合并方取得的凈資產賬面價值與支付的合并價款的差額，應當調整資本公積；資本公積不足沖減的，調整留存收益�？梢娫谶@種合并方式下是不確認合并商譽的。另一方面是非同一控制下的企業合并中商譽的確認問題。非同一控制下的企業合并，指不存在一方或多方控制的情況卞，一個企業購買另一個或多個企業入股權或凈資產的行為。其主要特征是參與合并的各方，在合并前后均不屬于同一方或多方最終控制。在非同一控制下的企業合并中采用的是購買法，即實施合并的企業以現金或其它非現金資產作為合并支付代價，購買被合并企業的凈資產而實現企業合并的會計處理方法。在購買法下，實施合并的企業在合并日，將購買的被合并企業的可辨認凈資產的公允價值記入實施合并企業的資產和負債，合并成本超過被合并企業可辨認凈資產公允價值的差額作為合并商譽。