2010年下半年，遼寧省廳對沈陽等14個市及所轄91個縣（市）區2009年1月至2010年5月新型農村合作醫療（以下簡稱新農合）基金的籌集、管理和使用開展了專項審計。針對審計發現的問題，向省政府上報了審計報告，并提出具體的審計建議。省委常委、常務副省長許衛國和副省長滕衛平分別對審計報告作出重要批示，要求省衛生廳和省財政廳認真落實整改，切實采納審計建議。

　　省衛生廳和財政廳對審計報告中提出的問題高度重視，采取多項措施認真進行整改，進一步強化了監管力度。

　　一是省人力資源和社會保障廳、省衛生廳、省財政廳建立了各部門間的工作協商機制，切實做好各項制度統計信息的銜接工作，對重復參合（保）現象起到了有效的監控作用。二是采用“雙信封”方法公開招標采購，同時制定限價和“基準價”等政策，進一步降低鄉鎮衛生院藥品價格。三是做好新農合基金補償與公共衛生專項補償的銜接。四是省財政廳根據各縣財力情況和項目性質制定更具針對性的資金配套方案，將補助資金向財力困難和保障任務重的縣予以傾斜。五是省財政廳建立了一套完整的與基本藥物制度相匹配的基層定點醫療機構補償機制。

　　此外，在新農合審計調查中，省廳共向省公安廳移送案件線索6件，其中3件經公安部門偵查確實已經立案，另外3件正在調查處理中。該項目審計被省直機關工委評為省直機關第二季度最佳實事。