為了滿足經濟社會發展對審計監督效能的新要求，近年來，福建審計廳不斷創新審計工作方法，努力提升審計質量和工作效率，積極打造高效型審計機關，促進年度各項審計任務落實。2010年該廳主要從三個方面對審計工作方法進行了探索和創新：

　　一是對經濟責任審計制度化、規范化進行探索和實踐。該廳2010年擬定并通過《福建省審計廳關于規范經濟責任審計評價細化責任界定的若干規定（試行）》，使審計評價和責任界定有章可循，規范了審計人員對領導干部經濟責任審計評價和責任界定。同時，進一步創新經濟責任審計方法，將市（縣、區）黨委和政府領導進行合并審計，在區分責任的基礎上出具一份報告，既提高了工作效率，又增強了審計報告的說服力和權威性。針對目前高校普遍實行黨委領導下的校長負責制，下一步擬對高校黨委書記、校長也實行合并審計。

　　二是為解決工程、投資、環保等專業審計力量不足與審計任務繁重的矛盾，該廳制定了《福建省審計廳關于選聘外部人員參與審計工作管理規定》，對聘用社會審計力量參與審計工作的原則、程序、方法、要求等作出了具體明確的規定，將社會審計力量的運用納入規范化軌道，對于確保審計質量具有重要作用。

　　三是研究制定審計風險點控制管理辦法，將提高審計工作效率與防范審計風險、預防腐敗有機結合起來。該廳按照審計工作流程，區分不同審計類型，對各環節易發生的審計風險點進行系統梳理，對審計人員應注意的事項和應采取的防范措施逐項明確、逐條規范，將依法行政、廉政建設等工作融入到具體審計之中。