余杭區審計局在2009年度本級財政預算執行情況審計中，對稅費征管、財政預算、資產管理等方面存在的問題從制度層面提出了意見和建議，引起了區政府的高度重視，并要求相關部門根據審計報告反映的問題積極整改。相關部門通過完善措施、健全制度，規范了以下五個方面的管理。

　　一是規范了對房地產企業的稅收征管。地稅部門除追繳審計報告反映的11家房地產企業1179.82萬元稅款外，還及時組織各分局開展了房地產企業納稅評估和專項檢查，研究出臺了城鎮土地使用稅基礎數據動態管理辦法，完善了計稅依據動態管理機制。

　　二是規范了對財政預算的管理。首先，財政部門根據審計意見規范了基金預算管理，將原先未進指標系統的土地出讓金、政府性基金等悉數納入，形成與一般預算相同的預算管理模式。其次，對結余指標進行專項清理，調減了無實質性用途的結余指標，并將通過按項目按進度細化預算的方式從根本上解決指標結余過大問題。同時，通過整合專項資金、強化項目臺賬管理等措施，細化了專項資金預算，提高了專項資金預算安排的準確率。

　　三是規范了對非稅收入的征管。為扭轉現行非稅收入征收系統無法全面反映收費項目的情況，財政部門于2010年11月投入運行一套新的征管系統。新系統采用在線、離線兩種模式，實現非稅收入“單位開票、銀行代收、財政統管”的征繳模式，不僅完善了征收手段，也大大提高了征管效率。

　　四是規范了對國有資產的管理。面對固定資產管理薄弱問題，國資部門迅速啟動了對區級行政事業單位固定資產的清查，并實行了條形碼管理。同時出臺《余杭區區級行政事業單位資產處置辦法》，進一步規范了行政事業單位資產處置工作。

　　五是規范了對政府投資項目的監管。為加強監管，區政府出臺《政府投資項目業主單位第一責任人制度（試行）》，明確了業主單位在項目建設各階段的管理職責，細化了責任追究規定，加大了責任追究力度。同時，區政府進一步明確和部署全過程跟蹤審計、項目管理制度執行情況審計等工作，強化對政府投資項目的監管力度。