南京市審計局2009年度同級財政審計工作受到了市政府、市人大以及有關部門的高度重視。審計工作報告獲得了市人大主要領導批示，市政府根據審計建議出臺和完善了《關于進一步加強全市政府非稅收入收支管理意見》等制度，進一步強化和完善了財政資金監督管理機制。

　　近年來，在財政審計實踐中，該局積極探索“一條主線”的大財政審計理念，深化財政審計工作。“一條主線”，即以財政預算執行為主線，部門預算等財政改革事項作為關鍵環節，通過揭示財政性資金在預算分配、預算執行和管理方面存在的問題，促進財政資金的分配公開性、管理科學性和使用效益性。

　　該局在構建財政審計大格局中，緊緊抓住財政預算執行這條主線，突出三個方面重點：一是圍繞市委、市政府的中心工作以及人大關注的熱點，加強對事關人民群眾切身利益專項資金的審計，先后安排了“綠色南京”資金、城鎮職工基本養老保險資金、環境保護資金等專項資金的籌集、管理和使用情況的審計和審計調查，促進了財政專項資金管理的進一步規范。二是圍繞全市財政改革的重點以及推進過程中的難點，加強對預算分配和執行、部門預算、國庫集中支付、政府非稅收入的審計，促進了財政改革的進一步深化。三是圍繞提高財政資金的使用績效，以提高“兩個報告”質量為抓手，從市本級預算執行和預算管理情況、專項資金管理績效情況、政府投資項目建設管理情況等方面，反映區域財政運行中存在的普遍性和傾向性問題，促進財政由“分配管理”向“績效管理”的轉變。