專項資金審計是財政審計的重要組成部分，開展好專項資金審計，有利于促進政府職能實現，提高財政資金使用效益。要做好財政專項資金審計，應把握好以下幾個重點環節：一是審前要熟悉專項資金的法律、法規、政策。在審前調查時，要搜集各級各部門出臺的政策文件，只有全面領會政策規定和專項管理要求，在審計時才能抓住重點，有的放矢。二是沿著資金流向，實行“點、線、面”結合審計。審計時要從資金安排的源頭“點”上檢查，確認資金來源渠道和資金安排的科學性、合理性、及時性；沿著資金流向形成的“線”，檢查資金在各個節點管理使用的效率，有無截留、挪用問題，以及再分配過程是否嚴格執行政策規定；在資金具體使用的“面”上，即各個項目實施單位，是資金流向的終點，也是專項資金審計的重點，主要檢查資金使用的真實性、合法性、效益性，側重檢查資金使用的績效。三是從全局高度提出有針對性的審計意見和建議。我們審計人員要具備一定的政策理論水平和宏觀分析能力，站在政府宏觀管理、經濟決策的高度，剖析專項資金管理使用中存在的問題及成因，提出切實可行的解決辦法，促進政府完善政策、法規，加強財政管理，提高資金使用效益，發揮審計在經濟運行中的“免疫系統”功能。