于田縣為強化對農村綜合改革的組織領導，加強綜改部門的執行力建設，高位推動農村綜合改革工作，進一步加強了農村綜合改革工作機構建設。

　　一是建立健全農村綜合改革領導小組，領導小組設在縣人民政府，由政府常務副縣長擔任縣農村綜合改革領導小組組長，分管縣農村綜合改革領導小組辦公室工作。

　　二是加強縣農村綜合改革領導小組辦公室建設工作，縣農村綜合改革領導小組下設辦公室，縣綜改辦掛靠縣財政局，縣人民政府任命一名正科級干部擔任縣農村綜合改革領導小組辦公室專職務副主任，負責辦公室日常事務工作，明確了辦公室專門工作人員，每年工作經費納入縣財政部門預算。

　　三是建立健全各鄉鎮農村綜合改革領導小組，由各鄉鎮分管財政工作的鄉鎮領導具體負責農村綜合改革工作，各鄉鎮財政所和農經站具體承擔農村綜合改革工作業務。