瑤海區教育局重視發揮內部審計的作用，自 1995年成立內審機構以來，先后對全區范圍內五十多所中小學校開展了財務收支審計、零星基建審計、校長離任經濟責任審計，查出違紀（規）金額70多萬元，并對審計發現的違法違規和損失浪費行為提出糾正、處理意見，規范了學校財務管理，嚴肅了財經紀律，并促進增收節支、提高經濟效益。1999年、2004年該內審機構分別被評為合肥市教育內審先進單位、合肥市內審先進單位。

　　為進一步加大內部審計的監督力度，近年來，該局采取有關措施大力推進內部審計工作，主要做法是：（1）保持內審隊伍的穩定性，提高內審人員素質。該局在調整機關人員工作崗位時，注意保持內審隊伍的穩定，始終確保有四名專兼職審計人員堅守在內審工作一線；積極安排內審人員參加業務培訓學習，并給予經費保證。（2）不斷加強制度建設，規范內審工作。相繼制定了《瑤海區教育局內部審計工作意見》、《瑤海區教育局審計科工作職責》、《瑤海區教育局內審人員職業道德規范》等項制度，促進了內審工作規范化，嚴肅了內審人員職業紀律。（3）拓展內部審計范圍，擴大內審機構的影響力。根據區審計局對內審機構工作的業務指導意見，該局建立了校長任期經濟責任審計制度和零星基建工程決算審計制度，對離任的中小學校校長全面開展經濟責任審計，對各校零星基建項目實行峻工決算審計，以規范各校基建開支，提高教育資金的使用效益。（4）從加強各校內部控制著手，該局加大對各校會計人員的業務培訓工作，提升財會人員素質。