1、新申報表在設計上既注重與會計制度協調，又區分稅法與會計制度的差異

　　納稅申報既要依據稅法，申報的基礎信息又來源于會計。因此，新納稅申報表在設計上既注意利用會計信息，又對稅法與會計制度的差異單獨列示。例如，收入總額所包括的主營業務收入、其他業務收入、營業外收入與《企業會計制度》核算內容完全一致，扣除項目所包括的主營業務成本、其他業務支出、營業外支出也與《企業會計制度》相吻合。對于《企業會計制度》中的非貨幣性交換、產品自用、捐贈等不作為銷售的業務，單獨設置了“視同銷售收入”、“稅法上應確認的其他收入”、“視同銷售成本”和“稅法上應確認的其他成本費用”項目。在扣除項目中取消了“期間費用合計”這一含糊不清的項目，直接采用會計制度中的“期間費用”（包括管理費用、營業費用、財務費用）填列，相比舊申報表填寫簡單。

　　2、新申報表增加了納稅調整增加項目明細表

　　增加了本期發生數、稅前扣除限額、納稅調增金額，通過比對計算納稅調增金額，使計算過程更加清楚。

　　為了適應房地產開發企業就預收售房款交納企業所得稅的需要，納稅申報表還增加了第36行“本期預收收入的預計利潤”。

　　3、新申報表增加了納稅調整減少項目

　　對于納稅調減項目中，充分考慮了會計制度與稅法的差異。下面列示主要的納稅調減項目：

　　（1）國稅發[1998]86號文件規定：經批準實行工效掛鉤的企業，經主管稅務機關審核，具實發放的工資額可在稅前扣除，提取的工資額超過實際發放部分，不得在稅前扣除；超過部分用于建立工資儲備基金，在以后年度實際發放時，經稅務機關審核，在實際發放年度企業所得稅前據實扣除。設置了附表五第1行“工效掛鉤企業用工資基金節余發放的工資”。

　　（2）企業執行財政部財企[2003]61號文件，在應付福利費中列支的基本醫療保險、補充醫療保險，可以在年度納稅申報時調減應納稅所得額。

　　（3）國稅發[2003]45號文件規定：企業已提取準備的資產，并且納稅申報時已調增了應納稅所得額，因價值恢復或轉讓處置有關資產而沖銷的準備，允許做相反納稅調整。按《企業會計制度》規定計提的八項減值準備，除5‰的壞帳準備金可在稅前扣除之外，其余都要做納稅調整，因為價值恢復等原因沖銷的準備金，可在附表五調減應納稅所得額。

　　（4）現行會計準則按照重要性原則對非貨幣性交易、債務重組等按賬面價值結轉成本，不做銷售處理，但是稅法要求作視同銷售處理。非貨幣資產公允價值與賬面價值的差額調增了應納稅所得額，當計提折舊、結轉成本、處置資產時應把原來調增的應納稅所得額加以調減。因此，在附表五增加了第17行“其他納稅調減項目”，并備有三行明細，要求按具體交易事項填列。

　　4、新申報表在整體形式結構上有新的創意

　　新申報表減少了主表的行次（舊申報表主表過于龐雜，有83行之多，主表與附表之間的鉤稽關系不清晰），增加了附表，這樣把原來在主表中表達不清的內容在附表中分項列示，層次分明，內容清晰，與主表的相關行次有一一對應的鉤稽關系。新申報表完全貫徹了《企業所得稅匯算清繳管理辦法》（國稅發[2005]200號）的規定，所得稅匯算清繳的主體是納稅人，取消了扣除項目的稅前審批。全套報表都由納稅人自行填報，并對納稅申報的真實性、準確性和完整性負法律責任。

　　5、研究開發費用當年抵扣不足可結轉以后年度抵扣，增加了扣除數額

　　國稅發[1996]152號文件規定：盈利企業研究開發費用比上年增長達到10%以上的，其實際發生額的50%如大于企業當年應納稅所得額，可就其不超過應納稅所得額的部分，予以抵扣；超過部分，當年和以后年度均不再抵扣。新申報表按照國務院《關于印發實施國家中長期科學和技術發展規劃綱要（2006-2020年）若干配套政策的通知》（國發[2006]6號）、和財稅[2006]88號文件的有關規定，企業技術開發費加計扣除不再設置當年支出比上年增長10%的前置條件，允許企業按技術開發費實際發生額的150%抵扣當年應納稅所得額，實際發生的技術開發費當年抵扣不足的部分，可按稅法規定在5年內結轉抵扣。

　　6、廣告費、業務招待費等扣除項目的計算基數為“銷售（營業）收入”

　　《企業所得稅稅前扣除辦法》（國稅發[2000]84號）規定，廣告費、業務宣傳費稅前扣除的計算基數為銷售（營業）收入；業務招待費稅前扣除的計算基數為銷售（營業）收入凈額。新納稅申報表規定：廣告費、業務招待費、業務宣傳費等項扣除的計算基數為申報表主表第1行“銷售（營業）收入”。新申報表對企業發生的現金折扣計入財務費用，銷售退回及銷售折讓以凈值反映在銷售（營業）收入中，新申報表的銷售（營業）收入實際就是原申報表的銷售（營業）收入凈額，廣告費和業務宣傳費的稅前扣除基數相應減少，現金折扣可以計入財務費用稅前扣除。

　　7、福利企業的減免稅額的填列辦法

　　《關于明確企業所得稅納稅申報表執行口徑等有關問題的通知》（國稅函[2006]1043號）文件對福利企業稅收優惠填報規定如下：福利企業稅收優惠政策調整試點地區的企業，按《財政部國家稅務總局關于調整完善現行福利企業稅收政策試點工作的通知》（財稅〔2006〕111號）要求進行試點的，其年度納稅申報時，應將按支付給殘疾職工工資額計算的加計扣除的部分，換算為減免稅額，并填報在《企業所得稅年度納稅申報表》附表七《免稅所得及減免稅明細表》第43行中。

　　8、工資薪金及三項經費的填列辦法

　　根據《財政部、國家稅務總局關于調整企業所得稅工資支出稅前扣除政策的通知》（財稅〔2006〕126號）和《國家稅務總局關于調整計稅工資政策具體實施有關問題的通知》（國稅發〔2006〕137號），從2006年7月1日起計稅工資稅前扣除標準調整到人均1600元/月。在2006年度納稅申報時，《工資薪金和工會經費等三項經費明細表》統一按計稅工資政策調整前的計稅工資標準進行填報，2006年7-12月提高稅前扣除標準后的差額在《企業所得稅年度納稅申報表》附表五《納稅調整減少項目明細表》第17行項下填報。從2007年度起，正常填報。