我公司是一家從事建筑安裝的企業，屬于XX建筑集團公司控股的子公司，因為集團公司無固定收入，故向下屬子公司收取一定比例（根據集團公司文件規定：按子公司總收入的5%）的管理費。但在今年的企業所得稅檢查中，我公司主管稅務機關認為該項支出不得稅前列支，我公司很疑惑：國稅總局不是說可以提取，支付總機構的管理費的嗎？為什么我們這里不能扣呢？

    答：根據你所提供的相關情況,我們認為貴公司在提取、支付總機構管理費時，以下幾個環節沒有處理好：

    1.你公司與集團公司的控股關系：根據《國家稅務總局關于總機構提取管理費稅前扣除審批辦法的補充通知 國稅函[1999]136號 以下簡稱通知》中第一款第四條的規定 “對母子公司體制的，管理費提取原則上僅限于全資子公司?！蹦愎緦儆诩瘓F公司的一家控股子公司，所以在控股關系上不符合。

    2.計提的比例：根據《通知》第二款第二條“管理費提取采取比例和定額控制。提取比例一般不得超過總收入的2%.”貴公司提取的比例為5%，已經超過了標準。

    3.計提的依據不恰當：根據《通知》第四款第一條的規定“由總機構向所在地主管稅務機關提出申請，稅務機關逐級審核上報。”也就是說，你應該以總機構獲得的主管稅務機關的審批文件為法定依據，而不能以集團公司的內部文件為依據。

    4.相關的一些處罰規定：對納稅人有意弄虛作假騙取審批管理費、多提管理費以及未經批準提取管理費的，稅務機關不予審批，稅前不準扣除，已審批的要撤銷審批，進行納稅調整。此外，還可根據《中華人民共和國稅收征收管理法》等有關規定，予以處罰。

    請貴公司參照以上所列的相關規定，提取、支付總機構管理費。只要貴公司是按稅法規定列支的總機構管理費是可以稅前扣除的。