對于企業出口貨物適用于既免稅又退稅的政策時，會涉及到如何退稅的問題。我國的《出口貨物退〈免〉稅管理辦法》規定了兩種退稅計算辦法：一種是“免、抵、退”的辦法，即出口企業兼營內銷和出口貨物，且其出口貨物不能單獨設賬核算的，應先對出口的貨物免征出口環節的增值稅，然后對內銷貨物計算銷項稅額并扣除當期進項稅額后，對未抵扣完的進項稅額再用公式計算出口貨物的應退稅額；另一種是“先征后退”辦法，即出口企業將出口貨物單獨設立庫存賬和銷售賬記載的，就依據購進出口貨物增值稅專用發票所列明的進項金額和退稅率計算應退稅額。

    2001年1月1日起，老外商投資企業（即1993年12月31日前批準成立的外商投資企業）自營或委托出口貨物將一律由原出口免稅改為出口退稅辦法，具體按現行自營生產企業“先征后退”或“免、抵、退”辦法進行，這意味著我國的老外商投資企業與別的生產企業出口退稅政策的統一。

    對于生產企業來說，到底選擇“先征后退”還是“免、抵、退”好呢？從長期來看，并沒有很大的區別，但從資金的占用及資金的時間價值來看，還是有一定區別的，具體籌劃如下：

    （1）若出口貨物進項稅額較大，應退稅額也比較大，同時內銷數量很小的情況下，出口企業應采用“先征后退”的辦法。主要是“先征后退”是按月辦理的，雖然出口企業每月向稅務局繳納出口貨物銷售收入對應的增值稅，但同時可以通過退稅得到補償。而此時如果采用“免、抵、退”的辦法，是按季度進行退稅的，而且退稅是有條件的，即出口貨物占當期全部貨物銷售額的50％以上。即使是退稅，也是不充分的，這樣長期占用了企業的資金。

    （2）若進項稅額較小，或內銷比例較大時，選擇“免、抵、退”方法比較有利。因為以內銷為主的出口企業采用“免、抵、退”方法，企業可以用出口免稅后的出口貨物進項稅額來抵頂內銷部分的銷項稅額，從而貨物的內銷部分應納稅額減少或為零，保證了企業資金不被長期占用。

    在實際生活中，確實有許多公司根據自身的情況來選擇出口退稅方式。如大連的東陶有限公司成立于1994年，該企業是以生產水栓五金配件為主的生產型外資企業，該企業經過深思熟慮后采用了“免、抵、退”方式。之所以這樣做是因為該企業內銷的比例比較大，出口、內銷各占50％左右，這樣該企業可以用出口免稅后的出口貨物進項稅額抵銷部分銷項稅額，減少資金的占用。大連造船新廠的財務處領導對兩種退稅方式有很深的感觸，他們認為，雖然“先征后退”方式征收多少稅就退多少稅，但這其中還涉及到一部分的地方稅要繳納給地方政府。例如，如果企業先繳納了1000萬元稅收，則企業很快就會收到1000萬元的退稅款，但就這1000萬元的增值稅款，企業要繳納7％的城建稅、3％的教育附加費，即繳納100萬元的地方稅，若采用“免、抵、退”方式，企業則不必繳納稅收。